掌握出轨证据，二审中法院会根据夫妻感情是否破裂及调解是否无效来判断是否判决离婚。依据《民法典》相关规定，如夫妻感情确已破裂且调解无效，一般会判离。
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针对被告掌握原告出轨证据的情况，法院会先尝试调解，若调解无果且确认双方感情破裂，将会依法判决离婚。同时需考虑子女抚养和财产分割等问题。
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在二审中，被告掌握原告出轨证据可能对判决产生影响。如夫妻感情确已破裂且调解无效，法院将支持离婚诉求。后续可能涉及财产分割和子女抚养等问题，需依法处理。