穿便衣查扣电动车在特定情况下合法。根据《中华人民共和国道路交通安全法》，交警在执行职务时，有权对违反交通法规的行为进行处罚，包括扣留违反交通法规的电动车。虽通常穿着制服，但在特殊情况下，如便衣侦查，交警也可能穿便衣。然而，必须严格遵守法律规定，确保执法合法公正。若便衣交警未出示证件、未告知扣留原因，或未开具扣留凭证，则可能存在问题。此时，问题已较严重，应及时寻求法律专业人士的帮助。
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从法律角度看，穿便衣查扣电动车的合法性取决于交警是否依法执行职务。常见处理方式包括：确认交警身份，要求其出示证件；了解扣留原因，核对相关法律依据；若认为执法不当，可申请行政复议或提起行政诉讼。选择处理方式时，应根据实际情况判断。若对交警身份或执法行为有疑问，应首先保持冷静，通过合法途径核实并维护自身权益。
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从法律角度分点简要呈现穿便衣查扣电动车在不同情况下的处理方式：1.**确认交警身份**：在交警穿便衣查扣电动车时，应要求其出示有效证件，如警察证，以确认其执法身份。2.**了解扣留原因**：询问交警扣留电动车的具体原因，并核对相关法律依据。根据《中华人民共和国道路交通安全法》，交警在电动车未悬挂车牌、未放置检验合格标志等情况下可扣留车辆。3.**申请行政复议或诉讼**：若认为交警的执法行为存在不当之处，如未出示证件、未告知扣留原因等，可依法申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自身合法权益。4.**寻求法律援助**：在整个过程中，若遇到法律难题或不确定如何处理，应及时寻求法律援助，咨询专业律师的意见。