尽管过了两年，员工仍可以起诉公司。但在起诉前，建议先申请劳动仲裁。根据《劳动合同法》，公司未按规定签订劳动合同属于违法行为，员工有权要求赔偿。请注意，未及时处理的纠纷可能会影响到追诉权利，因此应尽快行动以保护自身权益。
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员工可以选择通过申请劳动仲裁或起诉来处理此类纠纷。首先，建议尝试与公司进行协商，如果协商无果，可以向劳动仲裁机构申请仲裁。对仲裁结果不满的员工，可以进一步向法院提起诉讼。
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员工确实可以起诉公司，具体操作步骤如下：首先，收集相关证据，如工资单、工作记录等；其次，向劳动仲裁机构提交仲裁申请；最后，如果对仲裁结果不满，可以依法向法院提起诉讼。请务必妥善保留相关证据，以维护自己的合法权益。